- Geschäftsführender Institutsleiter Fraunhofer-Institut für Arbeitswirtschaft und Organisation IAO, Stuttgart
- Stellvertretender Institutsleiter Institut für Arbeitswissenschaft und Technologiemanagement IAT der Universität Stuttgart
- Vorsitzender des Fraunhofer-Verbunds Innovationsforschung
- Technologiebeauftragter des Landes Baden-Württemberg
- Geschäftsführender Verwaltungsrat der Fraunhofer Italia Research s.c.a.r.l.
Als geschäftsführender Institutsleiter führt Professor Bauer eine Forschungsorganisation mit etwa 650 Mitarbeitern.
Er verantwortet dabei Forschungs- und Umsetzungsprojekte in den Bereichen Innovationsforschung, Technologiemanagement, Leben und Arbeiten in der Zukunft und Smarter Cities.
Als Mitglied in verschiedenen Gremien berät er Politik und Wirtschaft. Bauer ist Autor von mehr als 350 wissenschaftlichen und technischen Veröffentlichungen.
An den Universitäten Stuttgart und Hannover ist er Lehrbeauftragter. Er erhielt die Ehrung des Landes Baden-Württemberg als »Übermorgenmacher«.